Ich hab dasselbe Problem. Bei mir ist es der Drosselklappen-Positionssensor. Hatte auch kurz die MKL mit Fehler "P2135 Throttle Position Sensor Voltage Correlation".
Sind genau die beschriebenen Symptome, kurze Gasstöße oder ungewollte Motorbremse bei niedrigen Drehzahlen, gelegentlich auch mieses Kaltstartverhalten mit Absterben des Motors.
Das Problem ist Yamaha bekannt, es gibt in sämtlichen MT09- und Tracer-Foren für die Modelle ab 2021 auch reichlich Threads dazu. Einfach nach "TPS" suchen.
Scheint ein Hardwareproblem mit dem Sensor zu sein. Bei mir wird der TPS auf Garantie getauscht, ist nur aktuell nicht lieferbar.